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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

广东侨乡信宜大芥菜：寒冬里的“家乡味道”******

　　中新社茂名1月14日电 题：广东侨乡信宜大芥菜：寒冬里的“家乡味道”

　　作者 梁盛 陈子楷

　　在广东侨乡信宜市，大芥菜是名副其实的“网红菜”。“天气越冷越好吃”是大芥菜众所周知的“天性”，而更让众多客居异国他乡的信宜籍乡亲在寒冬里惦记的，是大芥菜的“家乡味道”。

　　侨港信宜同乡会荣誉会长张权才近日受访时表示，信宜大芥菜又名大青菜，其最突出的特点是体型大、产量高、生产周期短，且信宜独特的地理环境，造就了其肉质鲜嫩，味微苦口甘的特点。其中，钱排镇冬季气候高寒，霜冻期长，加上当地种植使用的多是农家肥，因而种出来的大芥菜味道特好。

　　出生于信宜钱排镇云开村的张权才说，小时候村里的生活缺油少肉，乡亲们平时吃得最多的下饭菜就是清炒大芥菜。如今大家的生活水平提高了，通常会将大芥菜与腐竹、牛肉、猪杂等食品混炒，“腐竹炒菜梗”便是当地有名的农家菜，口味极佳，甜脆爽口，是餐桌上的一道美味佳肴。特别是外出的游子回乡省亲时，大芥菜几乎是每餐的首选菜式。

　　家住钱排镇的菜农程玉兰告诉记者：“自去年12月初以来，大芥菜经历了数次寒潮，这种持续低温天气，使得大芥菜特别‘吃香’。近段时间来，随着乡村旅游人气复苏，大芥菜也就成了游客的‘抢手货’。这半个月，我家卖给游客的大芥菜就超过了500公斤，收入大约5000元人民币。”

　　据程玉兰介绍，大芥菜盛产于冬季，生长环境气温要求较低，而且气温越低长得越快越旺。一般是10月份种植，一个月后就可以分梗采摘。在严寒霜冻期未到之前，大芥菜的味道一般，经历霜冻后的大芥菜，味道尤佳。除了清炒、拌炒，大芥菜还可以晾晒成干，以备在缺菜的季节食用，也可以用坛子封存，腌制成酸菜，有生津开胃、增强食欲的作用。

　　信宜市人大常委会副主任、钱排镇党委书记俞淮竞介绍说，大芥菜的采收期也是当地三华李的赏花期，信宜每年接待的赏花游客数以几十万计，给游客印象最深的，除了李花就是大芥菜，堂食之后游客往往还要捎上几捆带回家。

　　如今的信宜大芥菜闻名遐迩，还有了“信宜出品”“信字号”品控溯源“身份证”，销售包装也变得“高大上”。据悉，在钱排镇，今年大芥菜的种植面积和产量比上年明显扩增，将为当地千家万户带来一笔可观收入。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）